• 2022年第12期文章目次
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    • >专家论坛
    • 外泌体标志物及临床应用研究

      2022(12):881-885.

      摘要 (370) HTML (0) PDF 708.78 K (177) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:外泌体可由多种细胞分泌, 磷脂双分子层包裹多种生物活性分子如蛋白质、核苷酸、脂质及代谢产物等。外泌体在生理、病理过程中发挥重要作用,与多种疾病的发生和进展密切相关。外泌体相关的标志物在肿瘤.神经系统疾病、心血管疾病、 传染性疾病等多种疾病的诊断及预后判断中起着重要的作用。该文概述了近年来外泌体标志物及其临床应用研究的进展。

    • >临床检验技术研究
    • 基于CRISPR-Cas13a技术的乙型肝炎病毒ccDNA检测方法临床应用评价

      2022(12):886-890.

      摘要 (271) HTML (0) PDF 1.03 M (180) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的评价基于CRISPR-Cas13a技术的乙型肝炎病毒(HBV)共价闭合环状DNA(ceDNA)检测方法的应用价值。方法收集25例HBV感染患者和5例非HBV感染患者的肝组织标本,提取肝组织的总DNA,依次使用HindII内切酶和质粒安全 性ATP依赖DNA酶(PSAD)消化;设计HBV cceDNA的特异性引物,扩增消化后的产物;利用CRISPR/Cas13a技术建立CRISPR-HBV cceDNA检测方法,通过HBV cceDNA质粒和临床样本对该方法进行评价,并利用数字PCR和荧光定量PCR方 法进行比较。结果本研究建 立的方法检测HBV cccDNA质粒的灵敏度为1 copies/μL,显著高于数字PCR( 10 opies/μL,P<0.01)和荧光定量PCR( 10' copies/uL,P<0.01);建立的方法检测HBV cceDNA阳性样本的灵敏度为1 copies/uL,与数字PCR 相同,高于荧光定量PCR( 10 copies/ μL,P<0.01);建立的方法对25例HBV感染的临床肝组织样本的检出阳性率为80%,均高于数字PCR(64%)和荧光定量PCR(48%)。结论本研究 建立的CRISPR-HBV cceDNA检测方法在乙肝患者肝组织标本 HBVcccDNA检测中具有较高的灵敏度,为评价乙肝患者的临床治疗效果和监测停药复发等情况提供了有效帮助。

    • 基于临床表型的致病基因排序方法的模拟分析及验证

      2022(12):891-895.

      摘要 (189) HTML (0) PDF 1.60 M (164) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的开发一种基于临床表型的致病基因排序方法,提高致病基因检出的准确性。方法基于人类表型 本体( human phenotype ontology, HPO) 所生成的有向无环图中的拓扑信息,计算给定表型组与疾病表型间的相似度,建立致病基因排序新 方法;利用3075例模拟数据和385例已确定致病基因的外显子测序数据,分别进行模拟分析和效果验证。结果对比新方 法与5种已有方法的结果显示,在无噪声数据和不准确数据的模拟数据集中,新方法性能与3种已有方法差异无统计学意义。 在有噪声数据的模拟数据集中,新方法具有较高的敏感性,其对应疾病排名在候选列表第一、前五、前十、前二十位的百分比 分别为19.31%、37.85%. .47.90% 58.04%,均显著高于4种已有方法;在真实外显子测序数据中,新方法的对应致病基因排名 在候选列表第一、前五、前十、前二十位的百分比分别为41.56%、51.43%、58.18% .64.68%, 其敏感性高于其他方法( P<0.001)。 结论建立 了一种基于临床表型的致病基因排序方法,该方法具有较高的敏感性,有望提高外显子检测中致病基因筛查的准 确性。

    • >临床实验研究
    • 非小细胞肺癌患者血清细胞外囊泡let-7d-3p水平检测的临床价值

      2022(12):896-900.

      摘要 (398) HTML (0) PDF 550.72 K (177) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的检测 非小细胞肺癌( non-small ell lung carcinoma, NSCLC)患者血清细胞外囊泡( extracellular vesicles, EVs)中let-7d-3p水平的变化,评估其作为NSCIC患者辅助筛查液体活检分子标志物的临床应用价值。方法选取 2020年9月至2021年5月于东部战区总医院确诊的NSCLC 患者102 例及同期年龄、性别匹配的体检健康者70例,收集患者组及健康人对照组血清标本并分离EVs,采用实时荧光定量PCR ( quantitative real-time PCR , qRT-PCR)技术检测各组血清EVs中let-7d-3p表达水平变化,ROC曲线分析血清EVslet-7d-3p测定对于NSCLC患者的辅助筛查价值。结果与健康人对照组相比,NSCLC患者血清EVs中let-7d-3p 水平显著降低[ 69.75( 25.64, 154.70) fmol/L vs 26.09( 13.74 ,45.56)fmol/L],差异有统计学意义(U=1 830,P<0.001);同时,NSCLC I期患者[ 26.07(11.15, 45.30) fmol/L]血清EVs let-7d-3p 水平亦显著降低(U=1201 ,P<0.001)。ROC曲线分析结果显示,血清EVslet-7d-3p水平用于筛查NSCLC患者及I期患者的ROC曲线下面积(theareaundertheROC curve ,AUCROC )分别为0.744( 95% CI:0.667 ~ 0.821)和0.736( 95%CI:0.653~0.819);当cut-off 值为45.07 fmol/L时,血清EVs let-7d-3p筛查NSCLC及NSCLC I期患者的敏感性和特异性分别为74.5%和60% ,75.4%和60%。此外, NSCLC患者血清EVs .let-7d-3p水平不受年龄、 性别、吸烟史及病理类型的影响,差异均无统计学意义(P均>0.05)。结论NSCLC 患者尤其是早期患者血清EVs中let-7d-3p水平与健康人对照相比显著降低,具备作为NSCLC辅助筛查液体活检分子标志物的潜能。

    • LncRNA CASC7、miR-21 在支气管哮喘急性发作期患儿外周血中的表达及意义*

      2022(12):901-905.

      摘要 (360) HTML (0) PDF 769.41 K (197) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的检测 长链非编码RNA(LncRNA)癌易感性候选基因7(CASC7)、微小RNA-21(miR-21)在支气管哮喘急性发作期患儿外周血中的表达水平并分析其临床意义。方法选取 2020年6月至2021年10月在襄阳市中心医院就诊的支气管哮喘 急性发作期患儿115例(急性发作期组)以及支气管哮喘缓解期患儿97例(缓解期组),根据病情程度将急性发作期组患几分为轻度组45例,中度组39例,重度组31例。另收集同期体检健康儿童100 例(健康人对照组)。采用实时荧光定量PCR法: ( RT-qPCR)检测各组外周血LncRNA CASC7、miR-21的表达水平;检测第1秒用力呼气容积( forced expiratory volume in 1 second,FEV1)、用力肺活量( forced vital capacity , FVC)、 最大呼吸峰流速( peak expiratory flow,PEF)等肺功能指标;采用免疫比浊法检测超敏C反应蛋白(hs-CRP)的表达,ELISA法检测TNF-c.IL-6的表达水平;Pearson法分析LncRNACASC7、miR-21的表达与hs-CRP、TNF-a JL-6及FEV,、FVC、PEF的相关性,并进一步分析IncRNA CASC7与miR-21的相关性;ROC曲线分析In-cRNA CASC7、miR-21对支气管哮喘急性发作期患儿的鉴别诊断价值。结果RT-qPCR 检测结果显示,健康人对照组、急性发作期组、缓解期组患几外周血LncRNA CASC7的表达水平(1.09+0.18 vs 0.93+0.12 vs 0.65+0.10)依次降低(F= 289.447,P<0.05) ,miR-21的表达水平( 1.05+0.14 vs 1.72+0.35 vs 2.64+0.55)依次升高(F=440.557 ,P<0.05);轻度组、中度组、重度组哮喘患儿外周血LncRNA CASC7的表达水平( 0.78+0.09 vs 0.67+0.09 vs 0.44+0.08)依次降低( F= 140. 168,P<0.05),而miR-21的表达水平(2.34+0.32 vs 2.63+0.53 vs 2.98+0.42)依次升高( F= 20.625, P<0.05) ;Pearson相关性分析显示,支气管哮喘急性发作期患儿外周血LncRNA CASC7 与hs-CRP、TNF-a、IL-6的水平呈负相关(r分别为-0.423、-0.375.-0.398,P均<0.05),而与FEV:、FVC、PEF测定值呈正相关(r分别为0.321、0.453 、0.41,P均<0.05) ;miR-21与hs-CRP、TNF-cx、L-6水平呈正相关(r分别为0.479、0.501、0.373,P均<0.05),而与FEV、FVC、PEF测定值呈负相关(r分别为-0.334.-0.496、-0.505,P均<0.05);In-cRNA CASC7与miR-21的表达呈负相关(r=-0.568 ,P<0.05); LncRNA CASC7 鉴别诊断支气管哮喘急性发作期与缓解期的ROC曲线下面积( AUCROC )为0.863( 95%Cl:0.809~0.906),当cut-off 值为0.76时,其敏感性为78.26% ,特异性82.47% ;miR-21鉴别诊断二者的AUCROC为0.922( 95%CI:0.877~0.954),当cut-off 值为2.14时,其敏感性为82.61%,特异性为83.51%;二者联合检测鉴别诊断二者的AUCROC为0.955(95%CI:0.918~0.979) , 敏感性为89.57%,特异性为88.66%。结论支 气管哮喘急性发作期患儿外周血中LncRNA CASC7水平下调,miR-21水平.上调,且与病情严重程度有关;二者联合可作为支气管哮喘急性发作期的潜在辅助诊断指标。

    • IL-I3、IL-4及FCERIB基因多态性对吸入糖皮质激素治疗儿童哮喘疗效的影响*

      2022(12):906-911.

      摘要 (164) HTML (0) PDF 620.69 K (163) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的分析 IL-I3、IL-4及FCERIB基因多态性与吸入糖皮质激素(ICS)治疗儿童哮喘疗效的关系。方法将2020年1月至2022年1月于绍兴市第二医院就诊的急性发作期哮喘患儿56例作为急性发作期组,慢性持续期哮喘患儿52例作为慢性持续期组,临床缓解期哮喘患儿53例作为临床缓解期组,另选取同期体检健康者60例作为健康人对照组。采用化学发光法检测并分析不同分期患儿治疗前后血清IgE水平。采用实时荧光定量PCR法分析哮喘患儿以及健康人对照组口腔黏膜脱落细胞中IL-I3 基因rs20541位点、IL-4基因rs2243250 位点、FCERIB基因rs569108 位点多态性与患儿肺功能[1秒用力呼气容积(FEV1)、1秒用力呼气容积与最大肺活量比值( FEV1/VCmax)、用力呼出50%肺活量时的平均呼气流速(MEF50)]、呼出气一氧化氮(Fe-NO)以及儿童哮喘控制测试量表(C-ACT)评分变化的关系;根据治疗结果将患儿分为控制组49例、部分控制组37例和未控制组19例,比较不同分组间各基因型分布情况。结果治 疗前临床缓解期、慢性持续期、急性发作期哮喘患儿血清IgE水平依次升高( 335.42+37.34 IU/ mL vs 446.71+40.95 IU/mL vs 681.52+96.57 IU/mL,F=412.128,P<0.05);与治疗前相比,3组患儿治疗后血清IgE水平均降低( 335.42+37.34 IU/mL vs 158.71+ 28.38 IU/mL, 446.71+40.95 IU/mL vs 166. 92+29.56 IU/mL,681.52+96.57 IU/mL vs 435.17+62.15 IU/mL,t分别为28.195,39.949, 15.617,P均<0.05);健康人对照组、临床缓解期、慢性持续期+急性发作期患儿L-I3 JIL-4 、FCERIB基因表达型差异有统计学意义(X2分别为9.742,20.340,9.555,P均<0.05);患儿IL-I3 IL-4、FCERIB基因各基因型FEV1、VCmax、MEF50、Fe-NO、C-ACT治疗前后差异具有统计学意义(P均<0.05);IL-13基因ns20541位点控制组AA型(4.1% vs21.1%) A等位基因比例(9.2% vs42.1%) ,IL-4基因rs2243250位点控制组T等位基因比例( 17.3% vs 10.5%),FCERIB基因rs569108位点控制组GG型(4.1% vs 31.6%) .G等位基因比例(11.2% vs 36.8%)低于未控制组,差异均有统计学意义(X2分别为4.902, 19.781 ,7.451,5.127,11.977,P均<0.05)。结论FCERIB 基因rs569108位点、IL-4基因rs2243250位点、JL-I3基因1rs20541 位点多态性与哮喘患儿ICS疗效相关,上述基因位点突变有助于预测哮喘患儿的ICS治疗效果。

    • 肾细胞癌患者血清miR-135b-5p表达变化的价值及功能

      2022(12):912-917.

      摘要 (163) HTML (0) PDF 2.29 M (173) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的检测肾细胞癌(renalcellcarcinoma,RCC)患者血清微小核糖核酸(microRNA,miRNA)-135b-5p的表达水平变化,探究其临床应用价值及其参与RCC发生、发展的作用机制。方法采用 荧光定量逆转录PCR( qRT-PCR)检测2022年1月至 6月于东部战区总医院泌尿外科就诊且经病理学确诊的60例RCC患者及60例健康人对照血清miR-135b-5p的表达水平变化,评估其对于RCC患者的临床辅助筛查价值。体外培养RCC细胞系(ACHNCaki-1)和正常肾小管上皮细胞系(HK-2),qRT-PCR检测细胞及细胞分泌的细胞外囊泡( extracellular vesicles ,EVs)中miR-135b-5p 的表达水平;进一步应用生物信息学分析、EVs与细胞共培养、细胞功能等方法探究EVs miR-135b-5p 参与RCC的初步作用分子机制。结果RCC 患者血清miR-135b-5p水平[ 6.932(5.524, 9.964)]与健康人对照[5.534(4.373, 6.555)]比较显著升高(U= 1 042,P<0.01)。血清miR-135b-5p水平对于RCC筛查的ROC曲线下面积( AUCR0C)为0. 711( 95% CI:O. 619~ 0.802)。ACHN和Caki-1 细胞中miR-135b-5p水平较正常HK-2 细胞中的表达倍数显著明显升高(分别升高了7.821 倍和1.919倍。P值分别为0.000 3和0.000 1);同时,ACHN和Caki-1 EVs中miR-135b-5p 水平较HK-2 EVs中的表达倍数亦显著增高(分别升高了3.783 倍和2.627倍。P值分别为0.0001和0.0004)。生物信息学分析结合文献调研显示,miR-135b-5p可能通过调控潜在靶基因血管生成素样蛋白4( angiopoietin-like protein 4 ,ANGPTL4)的表达而参与血管生成。RCC EVs与人脐静脉血管内皮细胞(HUVEC)共培养结果显示,RCC细胞分泌的富含miR-135b-5p EVs在与HUVEC温育的不同时间点(4h 6h和8 h)均可明显促进内皮细胞成环,差异具有统计学意义(P值分别为0.011 2 ,0.005 7,0.001 7)。Western blot结果显示,mimics 组ANGPTL4蛋白的表达水平为( 0.616+0.003) ,较NC组( 1.00+0.05)显著降低,差异具有统计学意义(t=12.44,P=0.000 2)。进一步分析发现与NC组相比, HUVEC中miR-135b-5p过表达组在连续观察时间内(2h、4h、6h和8 h)的成环数明显增加(P值分别为0.000 1 ,0.0001,0.0032,0.0095)。结论RCC患者血清、细胞系及细胞分泌的EVsmiR-135b-5p表达水平均显著升高,血清miR-135b-5p水平测定对于RCC具有较高的临床辅助筛查价值,RCC细胞分泌EVsmiR-135b-5p可通过调控ANGPTL4的表达,参与血管生成。

    • Dravet综合征SCNIA基因新突变及遗传咨询

      2022(12):918-921.

      摘要 (392) HTML (0) PDF 2.63 M (169) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的对2 例癫痫伴精神运动发育迟缓的患儿进行遗传学病因分析,旨在为患儿治疗及其家庭遗传咨询、生育指导提供依据。方法提取2例患儿及 其父母外周血基因组DNA并采用全外显子测序技术进行检测,按照美国医学遗传学与基因组 学学会(ACMG,2015)标准进行致病性分析,通过Sanger测序验证致病变异。结果全外显子测序结果发现,2例患儿电压门控性钠离子通道a1亚单位基因(SCNIA)基因存在c.5354T>C(p.11785T)和c.4380T>A(p.Y1460* )新发de novo杂合突变,分 别评估变异为可疑致病、致病突变位点,Sanger测序验证了该突变并确认双方父母相应位点均为野生型。结论结 合临床和基因诊断信息,2例患儿均被诊断为常染色体显性遺传病Dravet综合征,明确患儿的致病原因对于合理治疗方案的制定及其 家庭的优生优育、遗传咨询具有重要的意义。

    • 类风湿关节炎患者血清miR-125a-5p、miR-132的表达及意义

      2022(12):922-925.

      摘要 (384) HTML (0) PDF 627.27 K (176) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的探究类风湿关节 炎(RA)患者血清miR-125a-5p. miR-132 的表达水平及临床应用价值。方法选取2021年1月至2022年1月湖北省十堰市太和医院收治的92例RA患者作为RA组,同期体检健康者80例为健康人对照组,采集各研究对象的空腹静脉血标本,实时荧光定量PCR( qRT-PCR)检测miR- 125a-5p和miR-132的表达水平;Pearson法分析miR- 125a-5p与miR-132的相关性以及二者与红细胞沉降率( ESR)、类风湿因子(RF)、C反应蛋白(CRP)和28个关节疾病活动度评分( DAS28)的相关性;ROC曲线评估miR-125a-5p、miR-132 对RA的临床筛查价值。结果与健康人 对照组相比,RA组ESR、RF和CRP的含量以及miR-125a-5p的表达水平均显著升高,而miR-132 的表达水平显著降低,差异有统计学意义(P均<0.05)。高活动组miR-125a-5p的表达水平和DAS28评分显著高于中活动组和低活动组,且中活动组显著高于低活动组(P均<0.05);高活动组miR-132的表达水平显著低于中活动组和低活动组,且中活动组显著低于低活动组(P均<0.05)。RA患者血清miR-125a-5p 的表达与DAS28 评分、ESR、RF CRP呈正相关(P<0.05),而miR-132 的表达与miR-125a-5p 、DAS28评分、ESR、RF .CRP呈负相关( P<0.05)。miR-125a-5p. miR-132 联合检测筛查RA发生的ROC曲线下面积( AUCROC )为0.986(95%CI:0.973~0.998),显著高于二者单独筛查的0.948( 95% CI:0.919~ 0.976)和0. 884( 95%CI:0.834~0.934),差异有统计学意义( Z= 3.638, P<0.001;Z=3.184,P=0.023)。结论RA 患者血清miR-125a-5p表达水平升高,miR-132表达水平降低,二者联合对RA具有一定的临床筛查价值。

    • 基于代谢组学分析的18-三体妊娠羊水差异代谢物

      2022(12):926-928.

      摘要 (213) HTML (0) PDF 955.85 K (133) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的通过 非靶向代谢组学方法分析18-三体( trisomy 18,T18) 妊娠母体羊水样本,探索其差异代谢物。方法采用病 例-对照研究,以8例18-三体妊娠母体羊水样本为病例组,40例正常胎儿母体羊水样本为对照组,采用气相色谱飞行时间质 谱技术( GC-T0F/MS)检测两组羊水样本。采用主成分分析(PCA)和正交偏最小二乘法判别分析(OPIS-DA)模型分析代谢谱 差异,通过单维统计分析寻找差异代谢物。结果PCA 和OPLS-DA模型分析均显示病例组与对照组之间无明显分离趋势。 通过单维分析在两组间共发现5种差异代谢物,分别为甘油醛、葡萄糖酸、硫酸吲哚酚.磷酸盐和泛酸(P<0.05)。结论羊水 代谢组学证实18-三体妊娠存在多种代谢物水平的差异,为疾病的发生机制的探索提供了更多研究思路。

    • 1个结蛋白基因新突变致扩张型心肌病家系的临床特点及遗传分析

      2022(12):929-933.

      摘要 (244) HTML (0) PDF 3.38 M (161) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的对1 个扩张型心肌病的家系进行遗传学分析,探讨其致病性基因变异位点,为遗传咨询提供数据支持。方法收集该家系现存成员的临床资料和外周血,采用外周血DNA提取试剂盒提取白细胞基因组DNA,采用全外显子组二代测序技术筛选出与扩张型心肌病相关的可疑致病性变异,用Sanger 测序对变异位点进行验证,结合家系共分离分析及多种生物信息学方法(如UniProt、PolyPhen-2和Mutation taster 、ANTHEPROT PyM0L等)综合验证和预测该变异的有害性,并根据ACMG指南对该变异位点进一步解读。结果该扩张型心肌病家系符合常染色体显性遗传模式,患病成员均携带结蛋白基因(desmin,DES) ,是未曾报道过的一种杂合错义新突变DES c. 140G>T( p.Ser471le)。生物信息学预测结果显示,该突变可改变蛋白质的二级结构,增加其疏水性并使其抗原性下降,还可使该位点原有的氢键和潜在的磷酸化位点丢失。根据ACMG指南可将该突变解读为可能致病的变异。结论新发现的 DES基因c.140G>T(p.Ser47le)变异可能是该常染色体显性遗传家系的致病原因,该家系患者出现临床表型的时间相对较早且预后不良,突变的检测有助于患者早期诊断与个性化的临床管理及治疗。

    • 首发精神分裂症患者血清miR- 146a-5p、TRAF6的表达及意义

      2022(12):934-937.

      摘要 (354) HTML (0) PDF 649.97 K (150) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的探究首发 精神分裂症(SZ)患者血清微小RNA-146a-5p( miR-146a-5p)、肿瘤坏死因子受体相关因子6(TRAF6)的表达水平变化并分析其临床意义。方法选取2019 年2月至2021年4月于杭州师范大学附属萧山医院收治的95例首发SZ 患者作为SZ组,同期体检健康者98例作为健康人对照组;qRT-PCR检测各受试者血清miR- 146a-5p TRAF6 mRNA的表达水平;Pearson相关系数法分析miR-146a-5p与TRAF6 mRNA表达水平的相关性;以及二者分别与阳性和阴性症状量表( PANSS) 评分和威斯康星卡片分类测验(WCST)评分的相关性;ROC曲线评估miR-146a-5p与TRAF6在首发SZ中的诊断价值;Logistic回归分析影响首发sZ发生的因素。结果与健康人对照组相比,SZ组患者血清miR-146a-5p的表达水平显著降低,TRAF6 mRNA的表达水平显著增加( P<0.01),且二者呈显著负相关(r=-0.444,P= 0.000);与治疗前相比,治疗后SZ组患者血清miR-146a-5p的表达显著增加(P<0.01) , TRAF6 mRNA的表达显著降低(P<0.01),且二者呈显著负相关(r=-0.428,P= 0.000);PANSS总评分、PANSS阳性、-般精神病理症状非持续性错误数、错误应答数与miR-146a-5p 水平均呈负相关,而与TRAF6 mRNA水平均呈正相关( P<0.05) ;相较于miR-146a-5p. TRAF6 mRNA单独诊断首发SZ发生,二者联合检测诊断首发 SZ发生时的ROC曲线下面积显著增加(Z =2.037,P= 0.042;Z= 2.162,P=0.031) ;Logistic回归分析结果表明,miR-146a-5p低表达及TRAF6 高表达是影响首发SZ发生的危险因素。结论首发 SZ患者血清miR-146a-5p的表达显著降低, TRAF6 mRNA 的表达显著增加,且二者与疾病严重程度存在密切相关性,有望成为首发SZ的早期诊断指标。

    • circRNA_ 0085135 在胃癌患者血清中的表达及意义

      2022(12):938-940.

      摘要 (232) HTML (0) PDF 487.48 K (182) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的检测 环状非编码RNA( cireRNA)_ 0085135 在胃癌患者血清中的表达水平,分析其与患者临床病理参数的相关性以及对胃癌的临床诊断效能。方法收集62 例胃癌患者(胃癌组)、50例胃部良性疾病患者(良性疾病组)以及50例体检健 康者(健康人对照组)的血清样本。采用实时荧光定量PCR( RT-qPCR)检测胃癌患者、胃部良性疾病患者和体检健康者血清circRNA_ _0085135的表达水平。ROC曲线评估ceircRNA_ 0085135 对于胃癌的临床诊断价值,并分析circRNA_ 0085135 与胃癌患者临床病理参数的相关性。结果circRNA_ 0085135 在胃癌患者血清中的相对表达量为24.96( 10.51,41.45),显著高于胃部良性疾病组6.13(0.23,17.82)和健康人对照组0. 79(0.18,5.83),差异有统计学意义(H=61.79, P<0.0001),血清 circRNA_ _0085135诊断胃癌的ROC曲线下面积( AUCROC)为0.812 6( 95%Cl:0.7458~0.8794,P<0.000 1),当cut-off 值为6.390时,其敏感性为87.1% ,特异性为64.0%。血清circRNA. _0085135 表达量与TNM分期(x2=5.314,P=0.021)、肿瘤最大径(x2=9.789,P=0.002)、淋巴结转移(x2= 7.806,P=0.005)有关(P<0.05)。结论circRNA_ _0085135 在胃癌中呈高表达,并与TNM分期、大小和淋巴结转移有关,可作为胃癌潜在的诊断标志物。

    • >调查研究
    • 基于TCGA和ICGC数据库构建肾透明细胞癌的免疫相关预后模型

      2022(12):941-948.

      摘要 (440) HTML (0) PDF 5.08 M (173) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的构建和验证肾透明细胞癌(kidneyclearcellcarcinoma,KIRC)的免疫相关预后模型在临床风险分层和预后预测的应用价值,探索肿瘤免疫微环境的特征。方法从癌症基因组图谱(TheCancerGenomeAtlas,TCGA)和国际癌症基因组联盟 ( International Cancer Genome Consortium,ICGC)下载KIRC队列mRNA表达数据集,分别作为目标数据集和验证数据集,从免疫学数据库和分析平台( Immunology Database and Analysis Portal, ,ImmPort)中 下载免疫相关基因列表。基于以上数据集,筛选出差异表达的免疫相关基因并以此构建和验证预后模型。基于预后模型得出的风险评分对肿瘤样本进行分组,探究不同风险评分等级下的免疫细胞浸润水平、免疫检查位点及其配体表达水平的差异。结果共筛选出 11 个差异表达且关联预后的免疫相关基因,以此构建的预后模型预测3年、4年、5年生存率的ROC曲线下面积分别为0.669. 0.707和0.750。基于该模型得到的高风险评分与较高的肿瘤分期(P<0.05)、较差的预后(P<0.0001)均显著相关,并在验证数据集中得到进一步验证。在对总生存时间的风险率上,风险评分比差异表达的任一单个免疫相关基因高(风险率:1.93 vs 1.37), 但与肿瘤分期I期相当(风险率:1.93 vs 1.97)。基于风险评分分组,在高风险组和低风险组间的浸润程度存在显著差异的免疫细胞类型达12 种(P<0.05),其中,调节T细胞、M0型巨噬细胞、活化的记忆CD4*T细胞和休眠树突状细胞的浸润程度高低与预后均显著相关.(P<0.05)。此外,免疫治疗相关靶点的表达水平在不同风险评分等级中存在显著差异(P<0.05)。结论构建的 KIRC免疫相关预后模型在评估肿瘤分期和预后具有潜在的临床应用价值,有望为临床风险分层和免疫治疗提供证据。

    • 与发育癫痫性脑病9型相关的一-种新型PCDH19变体

      2022(12):949-952.

      摘要 (336) HTML (0) PDF 1.53 M (162) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的探讨一发育性癫痈性脑病9型( developmental and epileptic encephalopathy-9, DEE9)患儿的临床特点及遗传学病因,以提高临床医生对该疾病的认识。方法收集 DEE9患儿临床资料,采集患儿及其父母外周血并提取基因组DNA,通过全 外显子高通量测序进行基因检测,Sanger测序验证突变位点,总结临床特征并分析遗传病因。结果全外显 子组测序结合Sanger测序验证发现DEE9患儿原钙黏蛋白19(Protocadherin 19, PCDHI9)基因在1号外显子c.851_ _852 处存在GC二核苷酸 杂合性插入,导致PCDHI9发生移码突变。通过变异位点检测系统推测PCDHI9基因的c.851_ _852dupGC突变为致病突变,且与DEE9存在相关性。结论患儿 PCDHI9基因的1号外显子发生变异,导致其患X染色体遗传疾病DEE9,c. 851 _852dupGC是一种新型突变形式,该突变位点的确认有助于明确患儿疾病诊断及父母再生育指导。

    • 5410例优生咨询者的外周血染色体核型分析

      2022(12):953-955.

      摘要 (369) HTML (0) PDF 420.15 K (134) 评论 (0) 收藏

      摘要:摘要:目的探讨外周血染 色体核型分析在优生咨询中的临床应用价值。方法收集 2016年2月至2021年8月于上海市复旦大学附属中山医院辅助生殖科室进行优生咨询的患者5 410例,采集患者静脉血标本,采用外周血淋巴细胞培养方法培养、 收获、制片以及G显带后进行染色体核型分析。结果5 410例优生咨询者中异常染色体核型374例,检出率为6.9% (374/5 410),其中男性检出异常率为7.1%(194/2 746),女性检出异常率为6.8%( 180/2 664),两者间的差异无统计学意义(x2= 0.1994,P>0.05)。在374例异常染色体核型的患者中,染色体数目异常和结构异常率为14.97% (56/374)和13. 10% (49/374),嵌合体异常率为18.18%( 68/374),性反转异常率为0.8%(3/374),均低于染色体多态性改变的52.94%( 198/374),差异 有统计学意义(P>0.05)。结论染色体异常是 导致不孕不育、闭经、少弱精症的重要原因之一,外周血染色体核型分析可以为优生遗传咨询者明确病因,对于指导优生优育具有重要意义。

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