宏基因组下一代测序（metagenomic next-generation sequencing，mNGS）技术被广泛地应用于各种感染性疾病。血浆微生物游离DNA（microbial cell-free DNA，mcfDNA）近年来备受关注，其无创性和易获得性有助于识别人体内大部分来源的感染。了解血浆mcfDNA mNGS在感染性疾病诊断中的临床性能，不仅可加深对高通量测序的理解，还可为预防和治疗常见及罕见感染提供新的诊断途径。该文介绍了感染性疾病中血浆mcfDNA的生物学特点，血浆mcfDNA mNGS 在感染性疾病诊治中的实践应用以及面临的挑战。血浆mcfDNA mNGS作为一项新兴技术，有望提升感染性疾病预测、临床诊断和预后判断能力，特别是在传统诊断方法有局限性的领域。